=========================
  WORKSHOP ANNOUNCEMENT 
    CALL FOR PAPERS
=========================
ITAT 2013
Information Technologies - Applications and Theory
Workshop: Bioinformatics for genomes and proteomes
11.-15.9.2013
Hotel Zornička, Donovaly, Slovenská Republika
http://itat.ics.upjs.sk/
=========================

Vážení kolegovia,

v rámci konferencie

ITAT 2013: Information Technologies - Applications and Theory 
http://itat.ics.upjs.sk/

ktorá se bude konať 11.-15.9.2013 v hoteli Zornička na Donovaloch organizujeme 
workshop 

Bioinformatika v štúdiu genómov a proteómov 
http://itat.ics.upjs.sk/ITAT/Workshopy

Umiestnenie workshopu do informatickej konferencie má napomocť potrebnému 
zbližovaniu odborníkov z oblasti informatiky, biológie a interdisciplinárneho 
oboru akým je bioinformatika. V rámci konferencie budú organizované aj ďalšie 
workshopy, ktoré možu bioinformatikov osloviť, napríklad dva workshopy 
o dolovaní dát organizované kolegami z Prahy. Srdečne Vás pozývame a prosíme 
o preposlanie e-mailu prípadným záujemcom z Vášho okolia.

Workshop bude širšie uvedený motivačnou prednáškou pozvaného prednášajúceho 
z Biofyzikálneho ústavu AV ČR v Brne, Dr. Eduarda Kejnovského na tému 
"Skákající geny - paraziti nebo pomocníci?". 

Workshop poskytne možnosť prezentovať sa formou krátkych prednášok (cca 20 min) 
či posterov a k nim prislúchajúcich článkov. Tieto budú uverejnené 
v predkonferenčnom zborníku. Workshop, tak ako celá konferencia ITAT, bude 
prebiehať v príjemnom prostredí Nízkych Tatier. Poskytne priestor pre 
prezentáciu rozpracovaných i dokončených prác, ako teoretických tak 
i praktických, prevažne z oblasti bioinformatiky genómov a proteómov. 
Príspevky by sa mali týkať témy workshopu v najširšom zmysle slova, prípadne 
by mali mať vzťah k niektorej z nasledujúcich oblastí (zoznam nie je 
úplný):

- Analýza biologických sekvencií
- Spracovanie sekvenačných dát
- Anotácia genómov a proteómov
- Predikcia štruktúry a funkcie proteínov
- Software a hardware pre bioinformatiku
- Integrácia a dolovanie dát v genomike a proteomike
- Biomedicínske využitie bioinformatiky
- Mobilné a repetitívne sekvencie v genómoch
- Metódy štúdia vývoja alebo zmien v stavbe genómov
- Genómy a proteómy z pohľadu systémovej biológie.

Príspevky musia byť v rozsahu jednostranového abstraktu alebo článku 
v rozshu 4-8 strán, oboje v angličtine, pripravené podľa inštrukcií na webe 
konferencie ITAT:

http://itat.ics.upjs.sk/Site/InformaciePreAutorov

Doležité termíny:
2.6. zaslanie abstraktu
16.6. zaslanie článku
30.6. oznámenie o prijatí alebo zamietnutí článku
20.7. verzia článku do tlače

Príspevky budú zoradené podľa kvality hodnotenej programovým výborom. Ak
počet príspevkov presiahne časové možnosti workshopu, určitá časť 
prednášajúcich bude podľa rozhodnutia programového výboru vyzvaná pripraviť 
miesto prednášky plagátovú informáciu (poster). Príspevky nespĺňajúce 
minimálne kvalitatívne parametre stanovené programovým výborom nebudú prijaté 
do zborníka, ale budú mocť byť prezentované formou posteru (bude sa jednať
predovšetkým o jazykovú úroveň, dodržanie tematiky a menej prísne aj obsah textu, 
kde hľadáme nielen príspevky prinášajúce nové informácie alebo nový pohľad 
na existujúci problém, ale aj popisy metodických postupov a skúsenosti s nimi, 
výskumné smery a čerstvé výsledky sledované na pracoviskách prednášajúcich). 
Rozsah workshopu je približne 4 hodiny, t.j. maximálny počet príspevkov 
prijatých ako prednáška bude v rozmedzí 8-12.

Príspevky do workshopu budú zasielané prostredníctvom systému EasyChair, odkaz
nájdete na stránkach workshopu alebo konferencie. Príspevky zo všetkých ITAT
workshopov vyjdu v zláštnom zborníku s prideleným ISBN.

Zloženie programového výboru:
-----------------------------
Broňa Brejová, FMFI UK Bratislava
Ľuboš Kľúčar, SAV Bratislava
Tomáš Martínek, FIT VUT Brno
David Šafránek, FI MU Brno

/ITAT je česko-slovenská vedecká konferencia zameraná najmä na
prezentáciu výsledkov mladých vedeckých pracovníkov a doktorandov v
oblasti informatiky. Konferencia poskytuje priestor na výmenu
informácií v komunite, ako aj neformálne stretnutia účastníkov v
horskom prostredí. /

Tešíme sa na Vaše príspevky
za organizátorov workshopu

Matej Lexa