1-BIN-301, 2-AIN-501 Methods in Bioinformatics, 2022/23

Introduction · Rules · Tasks and dates · Materials · Moodle · Discussion
Quizzes can be found in Moodle.
Homework assignments and journal club papers can be found in Tasks and dates.
Groups for journal club have each their own channel in MS Teams.


Journal club papers: Rozdiel medzi revíziami

Z MBI
Prejsť na: navigácia, hľadanie
Riadok 1: Riadok 1:
Svoje preferencie ohľadom článkov na journal club odovzdajte pomocou [https://spreadsheets.google.com/viewform?formkey=dGtqZl8tQlhoNGd0R0E4cXdPWGJhVlE6MA tejto linky] najneskôr do '''20.10.2010'''. Vo forme uveďte čísla '''troch článkov z tohto zoznamu''' v poradí podľa preferencie.
+
Svoje preferencie ohľadom článkov na journal club odovzdajte pomocou [https://spreadsheets.google.com/viewform?formkey=dF9RRGwzUjJDNm96dTNqd0ZhOEZUeEE6MA tejto linky] najneskôr do '''20.10.2010'''. Vo forme uveďte čísla '''troch článkov z tohto zoznamu''' v poradí podľa preferencie.
  
  

Verzia zo dňa a času 10:22, 14. október 2010

Svoje preferencie ohľadom článkov na journal club odovzdajte pomocou tejto linky najneskôr do 20.10.2010. Vo forme uveďte čísla troch článkov z tohto zoznamu v poradí podľa preferencie.


  1. Lunter G (2007). "Probabilistic whole-genome alignments reveal high indel rates in the human and mouse genomes.". Bioinformatics 23 (13): i289-96. doi:10.1093/bioinformatics/btm185. PMID 17646308.
  2. Wapinski I, Pfeffer A, Friedman N, Regev A (2007). "Natural history and evolutionary principles of gene duplication in fungi". Nature 449 (7158): 54-61. doi:10.1038/nature06107. PMID 17805289.
  3. Clamp M, Fry B, Kamal M, Xie X, Cuff J, Lin MF et al. (2007). "Distinguishing protein-coding and noncoding genes in the human genome.". Proc Natl Acad Sci U S A 104 (49): 19428-33. doi:10.1073/pnas.0709013104. PMID 18040051.
  4. Harbison CT, Gordon DB, Lee TI, Rinaldi NJ, Macisaac KD, Danford TW et al. (2004). "Transcriptional regulatory code of a eukaryotic genome.". Nature 431 (7004): 99-104. doi:10.1038/nature02800. PMID 15343339.
  5. Bystroff C, Thorsson V, Baker D (August 2000). "HMMSTR: a hidden Markov model for local sequence-structure correlations in proteins". J. Mol. Biol. 301 (1): 173–90. doi:10.1006/jmbi.2000.3837. PMID 10926500.
  6. Andronescu M, Fejes AP, Hutter F, Hoos HH, Condon A (2004). "A new algorithm for RNA secondary structure design.". J Mol Biol 336 (3): 607-24. doi:10.1016/j.jmb.2003.12.041. PMID 15095976.