Prezentácia

Cieľom prezentácie je precvičiť si prácu s odbornou literatúrou a oboznámiť sa s ďalšími výsledkami v oblasti vyhľadávania v texte. Každý študent si zvolí a podrobne naštuduje jeden odborný článok (z odbornej konferencie alebo časopisu) z tejto oblasti a ten odprezentuje spolužiakom na prednáške koncom semestra. Každý študent si musí zvoliť iný článok. K tomuto článku môžete dostať otázku aj na skúške.

Termíny

• Výber článku na prezentáciu do piatka 22.4. v systéme Moodle. Každý článok môže prezentovať iba jeden študent, takže odovzdajte svôj výber radšej skôr. Kto si článok do uvedeného termínu nevyberie, bude mu nejaký priradený vyučujúcou.
• Prezentácie na prednáškach v posledných týždňoch semestra.
• Prezentáciu vo formáte pdf odovzdať prostredníctvom Moodlu najneskôr 1 hodinu pred prednáškou, na ktorej máte prezentovať.

Rady k prezentácii

• Na prezentáciu budete mať 15-20 minút, pričom tento limit bude striktne dodržiavaný. Nechystajte si teda priveľa materiálu, rátajte aspoň 1,5 minúty na slajd.
• K dispozícii bude dátový projektor a notebook, na ktorom bude nahraná vaša odovzdaná prezentácia. Môžete si priniesť aj vlastný počítač. Môžete použiť tabuľu, ale s mierou, lebo vysvetľovanie pri tabuli ide pomalšie.
• Hlavným cieľom je porozprávať niečo zaujímavé z vášho článku vo forme prístupnej vašim spolužiakom (ktorí chodili na tento predmet, nepamätajú si však každý detail z každej prednášky). Nemusíte pokryť celý obsah článku a nemusíte použiť rovnaké poradie, označenie alebo príklady, ako autori článku.
• Nedávajte do prezentácie veľa textu, použite dostatočne veľký font a dobre viditeľné farby (podobné farby, napr. žltá na bielej, nemusia byť na projektore vôbec viditeľné).
• Použite čo najmenej definícií a označenia. Pojmy, algoritmy a dôkazy radšej ilustrujte na obrázku alebo príklade, než zložitým textom.

Typická osnova prezentácie (podľa potreby ju však možete meniť):

• Úvod: aký problém autori študujú, prečo je dôležitý alebo zaujímavý, má nejaký vzťah k niečomu z prednášok?
• Prehľad výsledkov: V čom je presne prínos autorov oproti predchádzajúcim prácam? Nemusíte robiť rozsiahly prehľad predchádzajúcich prác, len uveďte, čo je v článku nové. Malo by to byť jasné najmä z úvodu a záveru článku.
• Jadro: Vysvetlite nejaký kúsok zo samotného obsahu článku (časť algoritmu alebo dôkazu, niektoré výsledky z testovania na dátach a pod.)
• Záver: zhrnutie prezentácie, váš názor (čo sa Vám na článku páčilo alebo nepáčilo)

Typy vhodných článkov

• Články o dátových štruktúrach alebo ich variantoch, ktoré neboli/nebudú pokryté na prednáške
• Články empiricky porovnávajúce dátové štruktúry na reálnych dátach alebo popisujúce použitie týchto algoritmov v reálnych aplikáciach.
• Články o podrobnejšej analýze dátových štruktúr: dolné a horné odhady, analýza v priemernom prípade a pod.

Príklady článkov

Zopár ukážok článkov, nemusíte si však vybrať z tohto zoznamu.

• J. Fischer, V. Heun (2006) Theoretical and Practical Improvements on the RMQ-Problem, with Applications to LCA and LCE. CPM 2006. Novší algoritmus na hľadanie najnižšieho spoločného predka, experimentálne porovnanie. pdf

• Alstrup, Stephen, Cyril Gavoille, Haim Kaplan, and Theis Rauhe. "Nearest common ancestors: A survey and a new algorithm for a distributed environment." Theory of Computing Systems 37, no. 3 (2004): 441-456. [1]

• Y. Xu, Y. Papakonstantinou (2007) Efficient LCA based keyword search in XML data. CIKM 2007: 1007-1010 pdf Vyhľadávanie v XML pomocou LCA.

• Hagai Cohen and Ely Porat (2010) Fast Set Intersection and Two-Patterns Matching. LATIN 2010. Pdf od vydavateľa Štruktúra na rýchlejšie hľadanie prienikov utriedených množín

• L. Heng, R. Durbin (2009): Fast and accurate short read alignment with Burrows-Wheeler transform. Bioinformatics 25(14): 1754-1760 pdf Aplikácia BWT v bioinformatike.

• Orlin, James B., et al. "A faster algorithm for the single source shortest path problem with few distinct positive lengths." Journal of Discrete Algorithms 8.2 (2010): 189-198. [2]

• Gonzalo Navarro, Yakov Nekrich: Optimal Dynamic Sequence Representations. SODA 2013: 865-876 [3]

• Holm, Jacob, Kristian De Lichtenberg, and Mikkel Thorup. "Poly-logarithmic deterministic fully-dynamic algorithms for connectivity, minimum spanning tree, 2-edge, and biconnectivity." Journal of the ACM (JACM) 48, no. 4 (2001): 723-760. pdf Ako udržiavať súvislé komponenty v dynamickom grafe. Dlhší článok, stačí naštudovať a prezentovať časť.

• Burcsi, Peter, Ferdinando Cicalese, Gabriele Fici, and Zsuzsanna Lipták. "Algorithms for jumbled pattern matching in strings." International Journal of Foundations of Computer Science 23, no. 02 (2012): 357-374. [4] Indexovanie textu aby sa dala vyhľadávať vzorka s permutovanými znakmi.

• Wild, Sebastian, and Markus E. Nebel. "Average case analysis of Java 7’s dual pivot quicksort." In Algorithms–ESA 2012, pp. 825-836. Springer Berlin Heidelberg, 2012. [5] Síce ide o triedenie a nie dátové štruktúry, ale tieto dve oblasti spolu úzko súvisia.

• Goel, Ashish, Sanjeev Khanna, Daniel H. Larkin, and Robert E. Tarjan. "Disjoint Set Union with Randomized Linking." SODA 2014 [6]

• Bender, Michael A., Roozbeh Ebrahimi, Jeremy T. Fineman, Golnaz Ghasemiesfeh, Rob Johnson, and Samuel McCauley. "Cache-Adaptive Algorithms." [7] Zovšeboecnenie modelu cache-oblivious algoritmov.

Rady k hľadaniu článkov

• Podľa kľúčových slov sa články dobre hľadajú na Google Scholar. Tam okrem iného nájdete aj linky na iné články, ktoré daný článok citujú, čo môže byť dobrý zdroj ďalších informácií.

• The DBLP Computer Science Bibliography je dobrý zdroj bibtexových záznamov, ak píšete projekt alebo inú prácu v Latexu a tiež sa dá použiť na nájdenie zoznamu článkov od jedného autora alebo z jednej konferencie a podobne.

• ISI Web of Knowledge je oficiálna databáza hlavne časopiseckých článkov a citácií, prístupná z fakultnej siete. Menej pohodlná na použitie ako Google Scholar.

• Konferencie CPM a SPIRE sú dobrým zdrojom článkov o vyhľadávaní v texte, iné dátové štuktúry nájdete na všeobecných konferenciách pre teoretickú informatiku, napr STOC, FOCS, SODA. ESA. WADS, MFCS, ISAAC. Praktické implementácie sú námetom konferencií WAE a ALENEX.

Väčšina databáz má linky na elektronické verzie článkov u vydavateľa. Tam väčšinou uvidíte aspoň volne prístupný abstrakt, ktorý vám pomôže rozhodnúť, či Vás článok zaujíma. Pre niektoré zdroje (napr. ACM, IEEE a ďalšie) je plný text článku prístupný z fakultnej siete. Z domu sa môžete prihlásiť cez univerzitný proxy (v prehliadači nastavte automatický konfiguračný skript http://www.uniba.sk/proxy.pac ). Celý text článku (pdf) sa v mnohých prípadoch dá nájsť na webe (napr. na webstránke autora). V najhoršom prípade, ak neviete zohnať článok, ktorý k projektu alebo prezentácii veľmi potrebujete, kontaktujte ma e-mailom a môžem sa pokúsiť ho zohnať.