1-BIN-301, 2-AIN-501 Methods in Bioinformatics

Website moved to https://fmfi-compbio.github.io/mbi/


Materials: Rozdiel medzi revíziami

Z MBI
Prejsť na: navigácia, hľadanie
Riadok 7: Riadok 7:
 
* '''DEKM''': Durbin, Eddy, Krogh, Mitchison: Biological sequence analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids. Cambridge University Press 1998.
 
* '''DEKM''': Durbin, Eddy, Krogh, Mitchison: Biological sequence analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids. Cambridge University Press 1998.
 
* '''ZB''': Zvelebil, Baum: Understanding Bioinformatics. Taylor & Francis 2008.
 
* '''ZB''': Zvelebil, Baum: Understanding Bioinformatics. Taylor & Francis 2008.
* '''JP''': Jones and Pevzner: An Introduction to Bioinformatics Algorithms. The MIT Press 2004.
 
  
 
Pri prednáškach uvádzame kapitoly najviac pokrývajúce učivo, ktoré plánujeme prebrať. Prezentácia materiálu v rámci prednášok sa obvykle nezhoduje s prezentáciou v učebniciach. Uvedené kapitoly by mali hlavne slúžiť ako doplňujúci materiál pre samoštúdium.
 
Pri prednáškach uvádzame kapitoly najviac pokrývajúce učivo, ktoré plánujeme prebrať. Prezentácia materiálu v rámci prednášok sa obvykle nezhoduje s prezentáciou v učebniciach. Uvedené kapitoly by mali hlavne slúžiť ako doplňujúci materiál pre samoštúdium.
Riadok 20: Riadok 19:
 
{{R | PR| Úvod, administratíva, ukážky bioinformatických problémov | {{pdf|p01}} | }}
 
{{R | PR| Úvod, administratíva, ukážky bioinformatických problémov | {{pdf|p01}} | }}
 
{{R | CI| Úvod do biológie | {{pdf|ci01}} | [[CI01|Poznámky]] }}
 
{{R | CI| Úvod do biológie | {{pdf|ci01}} | [[CI01|Poznámky]] }}
{{Lit | }}
+
{{Lit | ZB kap. 1}}
{{Lit | 123}}
+
 
{{R | CB| Úvod do informatiky | {{pdf|cb01}} | }}
 
{{R | CB| Úvod do informatiky | {{pdf|cb01}} | }}
 
|-
 
|-
 
{{T|29.9.-5.10|}}
 
{{T|29.9.-5.10|}}
 +
{{R | PR| Sekvenovanie a zostavovanie genómov | {{pdf|p02}} | }}
 +
{{Lit | BV kap. 1}}
 
|-
 
|-
 
{{T|6.-12.10.|}}
 
{{T|6.-12.10.|}}

Verzia zo dňa a času 10:11, 20. september 2014

Na tejto stránke nájdete orientačný rozvrh semestra, ktorý budeme priebežne aktualizovať. Poznámky z prednášok a ďalšie rozširujúce materiály budú pribúdať po skončení príslušných prednášok.

Literatúra:

  • BV: Brejová, Vinař: Metódy v bioinformatike. (predbežná verzia skrípt, iba niektoré prednášky)
    • Verzia z 2.1.2014: pdf
  • DEKM: Durbin, Eddy, Krogh, Mitchison: Biological sequence analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids. Cambridge University Press 1998.
  • ZB: Zvelebil, Baum: Understanding Bioinformatics. Taylor & Francis 2008.

Pri prednáškach uvádzame kapitoly najviac pokrývajúce učivo, ktoré plánujeme prebrať. Prezentácia materiálu v rámci prednášok sa obvykle nezhoduje s prezentáciou v učebniciach. Uvedené kapitoly by mali hlavne slúžiť ako doplňujúci materiál pre samoštúdium.

PR: spoločná prednáška, CI: cvičenia pre informatikov, CB: cvičenia pre biológov

22.-28.9.
PR: Úvod, administratíva, ukážky bioinformatických problémov pdf
CI: Úvod do biológie pdf Poznámky
ZB kap. 1
CB: Úvod do informatiky pdf
29.9.-5.10
PR: Sekvenovanie a zostavovanie genómov pdf
BV kap. 1
6.-12.10.
13.-19.10.
20.-26.10.
27.10.-2.11.
3.-9.11.
10.-16.11.
17.-23.11.
24.-30.11.
1.-7.12.
8.-14.12.
15.-21.12.