2-AIN-504: Seminár z bioinformatiky (2)
Leto 2009, archívna kópia
Rozvrh


Rozvrh | Základné informácie | Zoznam článkov | Ostatné semestre

Seminár:
Uto 17:20, I-9
 
Prednášajúci:
Mgr. Tomáš Vinař, PhD M-163, 60295207
Konzultačné hodiny: Štv 13:30-14:30
 
Oznamy:
  • 2009-02-12: Prosím, vyberte si čo najskôr článok, ktorý chcete prezentovať, a pošlite e-mail vyučujúcemu (doktorandi a študenti, čo si chcú predmet zapísať). Bližšie informácie na podstránkach "Základné informácie" a "Zoznam článkov".
  • 2009-02-12: Študenti PriFUK, ktorí si chcú predmet zapísať, si musia vyzdvihnúť na svojom študijnom oddelení príslušný formulár, vyplniť ho a doniesť ho na študijné oddelenie FMFI (miestnosť M-7, p. Parolková, každý deň 9-12 okrem štvrtka). Tento formulár môžete vyplnený doniesť aj na seminár 16.2.

 
Zoznam prezentácií:
17.2.2009
Broňa Brejová
Alexander Stark, Pouya Kheradpour, Leopold Parts, Julius Brennecke, Emily Hodges, Gregory J. Hannon, Manolis Kellis. Systematic discovery and characterization of fly microRNAs using 12 Drosophila genomes. Genome research, 2007. link
24.2.2009
Michal Burger
Crystal L. Kahn, Benjamin J. Raphael. A Parsimony Approach to Analysis of Human Segmental Duplications. In Pacific Symposium on Biocomputing (PSB 2009), 2009. link
3.3.2009
Peter Civáň
Olivier Elemento, Noam Slonim, Saeed Tavazoie. A universal framework for regulatory element discovery across all genomes and data types. Molecular cell, 2007. link
10.3.2009
Matúš Valach
Umadevi Paila, Rohini Kondam, Akash Ranjan. Genome bias influences amino acid choices: analysis of amino acid substitution and re-compilation of substitution matrices exclusive to an AT-biased genome. Nucleic acids research, 2008. link
17.3.2009
Juraj Mešťánek
Miklos Csuros, J. Andrew Holey, Igor B. Rogozin. In search of lost introns. Bioinformatics, 2007. link
24.3.2009
Michal Nanasi
Yanni Sun, Jeremy Buhler. Designing patterns for profile HMM search. Bioinformatics, 2007. link
31.3.2009
Juraj Kramara
Jennifer L. Caswell, Swapan Mallick, Daniel J. Richter, Julie Neubauer, Christine Schirmer, Sante Gnerre, David Reich. Analysis of chimpanzee history based on genome sequence alignments. PLoS Genet, 2008. link
7.4.2009
Kubo Kováč
Simon Wong, Mark A. Ragan. MACHOS: Markov clusters of homologous subsequences. Bioinformatics, 2008. link
14.4.2009
Veľká noc
21.4.2009
Veronika Kubíková
Gary Hon, Bing Ren, Wei Wang. ChromaSig: a probabilistic approach to finding common chromatin signatures in the human genome. PLoS Comput Biol, 2008. link
28.4.2009
Martin Gallus
Jun Z. Li, Devin M. Absher, Hua Tang, Audrey M. Southwick, Amanda M. Casto, Sohini Ramachandran, Howard M. Cann, Gregory S. Barsh, Marcus Feldman, Luigi L. Cavalli-Sforza, Richard M. Myers. Worldwide human relationships inferred from genome-wide patterns of variation. Science, 2008. link
5.5.2009
Alena Hercegová
Ting Wang, Jue Zeng, Craig B. Lowe, Robert G. Sellers, Sofie R. Salama, Min Yang, Shawn M. Burgess, Rainer K. Brachmann, David Haussler. Species-specific endogenous retroviruses shape the transcriptional network of the human tumor suppressor protein p53. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2007. link
12.5.2009
Marcela Kopásková
Peter Donnelly. Progress and challenges in genome-wide association studies in humans. Nature, 2008. link
26.5.2009
Tina Višňovská
Naomi Habib, Tommy Kaplan, Hanah Margalit, Nir Friedman. A novel Bayesian DNA motif comparison method for clustering and retrieval. PLoS Comput Biol, 2008. link


Maintained by 2-AIN-504 personnel