1-DAV-202 Data Management 2023/24
Previously 2-INF-185 Data Source Integration

Materials · Introduction · Rules · Contact
· Grades from marked homeworks are on the server in file /grades/userid.txt
· Dates of project submission and oral exams:
Early: submit project May 24 9:00am, oral exams May 27 1:00pm (limit 5 students).
Otherwise submit project June 11, 9:00am, oral exams June 18 and 21 (estimated 9:00am-1:00pm, schedule will be published before exam).
Sign up for one the exam days in AIS before June 11.
Remedial exams will take place in the last week of the exam period. Beware, there will not be much time to prepare a better project. Projects should be submitted as homeworks to /submit/project.
· Cloud homework is due on May 20 9:00am.


Difference between revisions of "Project topic"

From MAD
Jump to navigation Jump to search
 
(One intermediate revision by the same user not shown)
Line 1: Line 1:
−
Pre bioinformatikov (všetky tri majú potenciál pokračovať na bakalárskej práci):
+
Pre bioinformatikov:
−
* Spojenie proteomických a transkriptomických dát, program MaxQuant (projekt navrhla Dr. Martina Neboháčová, Katedra biochémie)
+
* Analýza metagenomických experimentov (zastúpenie rôznych druhov baktérií vo vzorke) v spolupráci s Lekárskou fakultou UK ([https://www.imbm.sk/sk/ skupina doc. Celeca])
−
* Analýza osekvenovaných kvasinkových genómov s pokračovaním na bakalárskej práci (školí B. Brejová v spolupráci s prof. Nosekom z Katedry biochémie)
+
* Analýza metabolomických dát v spolupráci s Lekárskou fakultou UK ([https://www.imbm.sk/sk/ skupina doc. Celeca])
−
* Analýza zhlukov génov v genómoch primátov s pokračovaním na bakalárskej práci (školí T. Vinař)
+
* Evolučné adaptácie psychrofilných kvasiniek v spolupráci s prof. Tomáškom, Katedra genetiky PriFUK
 +
* Spolupráca s Vedeckým parkom UK / firmou Geneton
 +
* Spolupráca s neuroimunologickým ústavom SAV
 +
* Analýza genómov alebo transkriptómov kvasiniek v spolupráci s prof. Nosekom, Katedra biochémie PriFUK
 +
* Môžete skúsiť osloviť aj ďalších vyučujúcich, ktorých poznáte z PriFUK

Latest revision as of 14:43, 28 March 2019

Pre bioinformatikov:

  • Analýza metagenomických experimentov (zastúpenie rôznych druhov baktérií vo vzorke) v spolupráci s Lekárskou fakultou UK (skupina doc. Celeca)
  • Analýza metabolomických dát v spolupráci s Lekárskou fakultou UK (skupina doc. Celeca)
  • Evolučné adaptácie psychrofilných kvasiniek v spolupráci s prof. Tomáškom, Katedra genetiky PriFUK
  • Spolupráca s Vedeckým parkom UK / firmou Geneton
  • Spolupráca s neuroimunologickým ústavom SAV
  • Analýza genómov alebo transkriptómov kvasiniek v spolupráci s prof. Nosekom, Katedra biochémie PriFUK
  • Môžete skúsiť osloviť aj ďalších vyučujúcich, ktorých poznáte z PriFUK
Retrieved from "https://compbio.fmph.uniba.sk/vyuka/mad/index.php?title=Project_topic&oldid=1016"