1-DAV-202 Data Management 2024/25

Materials · Introduction · Rules · Contact
· Grades from marked homeworks are on the server in file /grades/userid.txt
· Please submit project proposals until Monday April 14.


Difference between revisions of "Project topic"

From MAD
Jump to navigation Jump to search
 
(One intermediate revision by the same user not shown)
Line 1: Line 1:
Pre bioinformatikov (všetky tri majú potenciál pokračovať na bakalárskej práci):
+
Pre bioinformatikov:
* Spojenie proteomických a transkriptomických dát, program MaxQuant (projekt navrhla Dr. Martina Neboháčová, Katedra biochémie)
+
* Analýza metagenomických experimentov (zastúpenie rôznych druhov baktérií vo vzorke) v spolupráci s Lekárskou fakultou UK ([https://www.imbm.sk/sk/ skupina doc. Celeca])
* Analýza osekvenovaných kvasinkových genómov s pokračovaním na bakalárskej práci (školí B. Brejová v spolupráci s prof. Nosekom z Katedry biochémie)
+
* Analýza metabolomických dát v spolupráci s Lekárskou fakultou UK ([https://www.imbm.sk/sk/ skupina doc. Celeca])
* Analýza zhlukov génov v genómoch primátov s pokračovaním na bakalárskej práci (školí T. Vinař)
+
* Evolučné adaptácie psychrofilných kvasiniek v spolupráci s prof. Tomáškom, Katedra genetiky PriFUK
 +
* Spolupráca s Vedeckým parkom UK / firmou Geneton
 +
* Spolupráca s neuroimunologickým ústavom SAV
 +
* Analýza genómov alebo transkriptómov kvasiniek v spolupráci s prof. Nosekom, Katedra biochémie PriFUK
 +
* Môžete skúsiť osloviť aj ďalších vyučujúcich, ktorých poznáte z PriFUK

Latest revision as of 15:43, 28 March 2019

Pre bioinformatikov:

  • Analýza metagenomických experimentov (zastúpenie rôznych druhov baktérií vo vzorke) v spolupráci s Lekárskou fakultou UK (skupina doc. Celeca)
  • Analýza metabolomických dát v spolupráci s Lekárskou fakultou UK (skupina doc. Celeca)
  • Evolučné adaptácie psychrofilných kvasiniek v spolupráci s prof. Tomáškom, Katedra genetiky PriFUK
  • Spolupráca s Vedeckým parkom UK / firmou Geneton
  • Spolupráca s neuroimunologickým ústavom SAV
  • Analýza genómov alebo transkriptómov kvasiniek v spolupráci s prof. Nosekom, Katedra biochémie PriFUK
  • Môžete skúsiť osloviť aj ďalších vyučujúcich, ktorých poznáte z PriFUK