Rules

Grading

• Homeworks: 45%
• Project proposal: 5%
• Project and oral exam: 50%

Grades:

• A: 90 and more, B: 80...89, C: 70...79, D: 60...69, E: 50...59, FX: less than 50%

You can get Fx if your oral exam is not satisfactory, even if you have sufficient points from other actitivities.

Course format

• Každý týždeň 3 vyučovacie hodiny, z toho cca prvá je prednáška a ďalšie dve cvičenia. Na cvičeniach samostatne riešite príklady, ktoré dokončíte ako domácu úlohu.
• Niektoré týždne bude zvlášť úloha pre študentov bakalárskeho programu Bioinformatika a zvlášť pre ostatných. Ak by ste chceli riešiť iné zadanie, než je pre vás určené, musíte získať vopred súhlas vyučujúcich.
• Cez skúškové obdobie budete odovzdávať projekt. Po odovzdaní projektov sa bude konať ešte ústna skúška pozostávajúca z diskusie o projekte a prípadne dorábania menšieho vylepšenia projektu.
• Budete mať konto na Linuxovom serveri určenom pre tento predmet. Toto konto používajte len na účely tohto predmetu a snažte sa server príliš svojou aktivitou nepreťažiť, aby slúžil všetkým študentom. Akékoľvek pokusy úmyselne narušiť chod servera budú považované za vážne porušenie pravidiel predmetu.

Homework

• Termín DÚ týkajúcej sa aktuálnej prednášky je vždy do 9:00 v deň nasledujúcej prednášky (t.j. väčšinou o necelý týždeň od zadania).
• Domácu úlohu odporúčame začať robiť na cvičení, kde vám môžeme prípadne poradiť. Ak máte otázky neskôr, pýtajte sa vyučujúcich emailom.
• Domácu úlohu môžete robiť na ľubovoľnom počítači, pokiaľ možno pod Linuxom. Odovzdaný kód alebo príkazy by však mali byť spustiteľné na serveri pre tento predmet, nepoužívajte teda špeciálny softvér alebo nastavenia vášho počítača.
• Domáca úloha sa odovzdáva nakopírovaním požadovaných súborov do požadovaného adresára na serveri. Konkrétne požiadavky budú spresnené v zadaní.
• Ak sú mená súborov špecifikované v zadaní, dodržujte ich. Ak ich vymýšľate sami, nazvite ich rozumne. V prípade potreby si spravte aj podadresáre, napr. na jednotlivé príklady.
• Dbajte na prehľadnosť odovzdaného zdrojového kódu (odsadzovanie, rozumné názvy premenných, podľa potreby komentáre)

Protocols

• Väčšinou bude požadovanou súčasťou úlohy textový dokument nazvaný protokol.
• Protokol píšte v txt formáte a súbor nazvite protocol.txt (nakopírujte ho do odovzdaného adresára)
• Protokol môže byť po slovensky alebo po anglicky.
• Ak píšete s diakritikou, použite kódovanie UTF8, ale pre jednoduchosť môžete protokoly písať aj bez diakritiky.
• Vo väčšine úloh dostanete kostru protokolu, dodržujte ju.

Hlavička protokolu, vyhodnotenie

• Na vrchu protokolu uveďte názov domácej úluhy a vaše vyhodnotenie toho, ako sa vám úlohu podarilo vyriešiť. Vyhodnotenie je prehľadný zoznam všetkých príkladov zo zadania, ktoré ste aspoň začali riešiť a kódov označujúcich ich stupeň dokončenia:
  • kód HOTOVO uveďte, ak si myslíte, že tento príklad máte úplne a správne vyriešený
  • kód ČASŤ uveďte, ak ste nevyriešili príklad celý a do poznámky za kód stručne uveďte, čo máte hotové a čo nie, prípadne ktorými časťami si nie ste istí.
  • kód MOŽNO uveďte, ak príklad máte celý, ale nie ste si istí, či správne. Opäť v poznámke uveďte, čím si nie ste istí.
  • kód NIČ uveďte, ak ste príklad ani nezačali riešiť
• Vaše vyhodnotenie je pre nás pomôckou pri bodovaní. Príklady označené HOTOVO budeme kontrolovať námatkovo, k príkladom označeným MOŽNO sa vám pokúsime dať nejakú spätnú väzbu, takisto aj k príkladom označeným ČASŤ, kde v poznámke vyjadríte, že ste mali nejaké problémy.
• Pri vyhodnotení sa pokúste čo najlepšie posúdiť správnosť vašich riešení, pričom kvalita vášho seba-hodnotenia môže vplývať na celkový počet bodov.

Obsah protokolu

• Ak nie je v zadaní určené inak, protokol by mal obsahovať nasledovné údaje:
  • Zoznam odovzdaných súborov: o každom súbore uveďte jeho význam a či ste ho vyrobili ručne, získali z externých zdrojov alebo vypočítali nejakým programom. Ak máte väčšie množstvo súborov so systematickým pomenovaním, stačí vysvetliť schému názvov všeobecne. Súbory, ktorých mená sú špecifikované v zadaní, nemusíte v zozname uvádzať.
  • Postupnosť všetkých spustených príkazov, prípadne iných krokov, ktorými ste dospeli k získaným výsledkom. Tu uvádzajte príkazy na spracovanie dát a spúšťanie vašich či iných programov. Netreba uvádzať príkazy súvisiace so samotným programovaním (spúšťanie editora, nastavenie práv na spustenie a pod.), s kopírovaním úlohy na server a pod. Pri zložitejších príkazoch uveďte aj stručné komentáre, čo bolo účelom určitého príkazu alebo skupiny príkazov.
  • Zoznam zdrojov: webstránky a pod., ktoré ste pri riešení úlohy použili. Nemusíte uvádzať webstránku predmetu a zdroje odporučené priamo v zadaní.

Celkovo by protokol mal umožniť čitateľovi zorientovať sa vo vašich súboroch a tiež v prípade záujmu vykonať rovnaké výpočty, akými ste dospeli vy k výsledku. Nemusíte písať slohy, stačia zrozumiteľné a prehľadné heslovité poznámky.

Project

Cieľom projektu je vyskúšať si naučené zručnosti na konkrétnom projekte spracovania dát. Vašou úlohou je zohnať si dáta, tieto dáta analyzovať niektorými technikami z prednášok, prípadne aj inými technológiami a získané výsledky zobraziť v prehľadných grafoch a tabuľkách.

• Zhruba v dvoch tretinách semestra budete odovzdávať krátky návrh projektu
• Cez skúškové obdobie bude určený termín odovzdania projektu (vrátane písomnej správy)
• Projekty môžete robiť aj vo dvojici, vtedy však vyžadujeme rozsiahlejší projekt a každý člen by mal byť primárne zodpovedný za určitú časť projektu
• Po odovzdaní projektov sa bude konať ešte ústna skúška týkajúca sa projektu.

Viac informácií o projektoch na zvláštnej stránke

Academic integrity

• Máte povolené sa so spolužiakmi a ďalšími osobami rozprávať o domácich úlohách resp. projektoch a stratégiách na ich riešenie. Kód, získané výsledky aj text, ktorý odovzdáte, musí však byť vaša samostatná práca. Je zakázané ukazovať svoj kód alebo texty spolužiakom.

• Pri riešení domácej úlohy a projektu očakávame, že budete využívať internetové zdroje, najmä rôzne manuály a diskusné fóra k preberaným technológiám. Nesnažte sa však nájsť hotové riešenia zadaných úloh. Všetky použité zdroje uveďte v domácich úlohách a projektoch.

• Ak nájdeme prípady opisovania alebo nepovolených pomôcok, všetci zúčastnení študenti získajú za príslušnú domácu úlohu, projekt a pod. nula bodov (t.j. aj tí, ktorí dali spolužiakom odpísať) a prípad ďalej podstúpime na riešenie disciplinárnej komisii fakulty.

Zverejňovanie

Zadania a materiály k predmetu sú voľne prístupné na tejto stránke. Prosím vás ale, aby ste nezverejňovali ani inak nešírili vaše riešenia domácich úloh, ak nie je v zadaní povedané inak. Vaše projekty môžete zverejniť, pokiaľ to nie je v rozpore s vašou dohodou so zadávateľom projektu a poskytovateľom dát.