1-DAV-202 Data Management 2023/24
Previously 2-INF-185 Data Source Integration
Command-line basics
Jump to navigation
Jump to search
Contents
Files and folders
- Images, texts, data, etc. are stored in files
- Files are grouped in folders (directories) for better organization
- A folder can also contain other folders, forming a tree structure
Moving around folders (ls, cd)
- One folder is always selected as the current one; it is shown on the command line
- The list of files and folders in the current folder can be obtained with the ls command
- The list of files in some other folder can be obtained with the command ls other_folder
- The command cd new_folder changes the current folder to the specified new folder
- Notes: ls is an abbreviation of "list", cd is an abbreviation of "change directory"
Example:
- When we login to the server, we are in the folder /home/username.
- We then execute several commands listed below
- Using cd command, we move to folder /tasks/perl/ (computer does nto print anything, only cnages the current folder).
počítač nič nevypíše, iba zmení aktuálny adresár) a skúsime ls. Príkaz ls vypíše obsah adresára data-ppb/: podadresáre 2010-L, DU10, DU6, events a ukazka a súbor README. Nakoniec vypíšeme obsah podadresára events, ktorý obsahuje ďalšie podadresáre 2009 a 2010.
meno@vyuka:~$ cd /projects/data-ppb/ meno@vyuka:/projects/data-ppb$ ls 2010-L DU10 DU6 events README ukazka meno@vyuka:/projects/data-ppb$ ls events 2009 2010
Absolútne a relatívne cesty
- Absolútna cesta určuje, ako sa k danému súboru alebo adresáru dostať z koreňa
- Napr. /projects/data-ppb/, /projects/data-ppb/README, /projects/data-ppb/events/2009/Wed_25_Nov_2009, /home/meno/ atď
- Jednotlivé adresáre v strome sa oddeľujú lomítkom
- Absolútna cesta začína lomítkom
- Relatívna cesta určuje, ako sa k danému súboru dostať z aktuálneho adresára
- Napr. ak aktuálny adresár je /projects/data-ppb/, tak relatívna cesta k /projects/data-ppb/README je len README a relatívna cesta k /projects/data-ppb/events/2009/Wed_25_Nov_2009 je events/2009/Wed_25_Nov_2009
- Relatívna cesta nezačína lomítkom
- Relatívna cesta môže ísť aj hore do nadadresára, pomocou ..
- Napr. ak aktuálny adresár je /projects/data-ppb/events/2009, tak relatívna cesta ../../proteins nám dá to isté ako /projects/data-ppb/proteins
V príkazoch ls, cd a ďalších môžeme používať absolútne aj relatívne cesty.
Dôležité adresáre
- Koreň je adresár s cestou /, počiatočný bod stromovitej štruktúry adresárov
- Domovský adresár (home directory) /home/meno je aktuálny po prihlásení
- Tam si ukladáme väčšinu svojich súborov, ak nie je dobrý dôvod ich uložiť inde
- Skratka pre domovsky adresár je ~, napr. cd ~ vás tam presunie
Hviezdičková konvencia
- Príkaz ls namiesto všetkých súborov v adresári môže vypísať len tie, ktoré si vyberieme
- Všetky súbory v aktuálnom adresári začínajúce písmenom x vypíšeme pomocou ls x*
- Všetky súbory obsahujúce písmeno x hocikde v mene vypíšeme pomocou ls *x*
Prezeranie obsahu súboru (less)
- less subor
- Vypíše súbor na obrazovku, môžeme v ňom listovať pomocou medzery alebo Page up a Page down, vyskočíme pomocou q (ako quit), ďalšie klávesy sa dozviete po stlačení h (help)
Kopírovanie súborov (cp)
- cp odkiaľ kam
- Skopíruje súbor odkiaľ na miesto kam
- Môžeme použiť absolútne alebo relatívne cesty.
- Cieľové miesto kam môže byť adresár alebo celé meno súboru
Príklad: ak aktuálny adresár je /projects/data-ppb/, nasledujúce tri príkazy všetky kopírujú súbor README do poadresára events:
# relatívne cesty cp README events/ # absolútne cesty cp /projects/data-ppb/README /projects/data-ppb/events/ # celé meno súboru cp README events/README # tento príkaz kopíruje do /projects/data-ppb/events/README2 cp README events/README2 # ak sa presunieme do adresára events, môžeme kopírovať súbor do aktuálneho adresára . cd events cp ../README .
Kopírovanie súborov zo servera/na server (scp)
- Kríženec medzi ssh a cp (Secure CoPy)
- Na server (spustite na vašom linuxovom počítači napr. v učebni): scp subor meno@vyuka.compbio.fmph.uniba.sk:nove_meno_suboru
- Zo servera: scp meno@vyuka.compbio.fmph.uniba.sk:subor nove_meno_suboru
- Ak chcete kopírovať súbory medzi serverom a Windowsovým počítačom, nainštalujte si program WinSCP
#skopíruje súbor README2 do adresára /projects/data-ppb/ na serveri scp README2 hrasko37@vyuka.compbio.fmph.uniba.sk:/projects/data-ppb/ #skopíruje súbor README2 do domovského adresára užívateľa hrasko37 na serveri scp README2 hrasko37@vyuka.compbio.fmph.uniba.sk: #skopíruje súbor README2 do domovského adresára užívateľa hrasko37 pod menom README3 scp README2 hrasko37@vyuka.compbio.fmph.uniba.sk:README3 #skopíruje súbor README2 z domovského adresára užívateľa hrasko37 na serveri do aktuálneho adresára scp hrasko37@vyuka.compbio.fmph.uniba.sk:README2 .
Poznámky
Upozornenie: dvakrát meraj, raz rež
- Príkazový riadok spraví, čo napíšete, nepýta sa, či to myslíte naozaj
- Príkazy cp a scp môžu prepísať už existujúce súbory
- Neexistuje undo
- Preto si vždy dobre premyslite, čo chcete spraviť a skontrolujte príkaz pred tým, ako dáte Enter
Zjednodušenie práce
Užitočné pomôcky na príkazovom riadku:
- kláves Tab
- ak je len jeden súbor alebo adresár, ktorý pasuje na rozpísaný začiatok slova, doplní ho automaticky
- ak je súborov alebo adresárov viac, doplní, čo majú spoločné,po opakovanom stlačení ponúkne možnosti
- šípky hore/dole
- prechádzanie históriou spustených príkazov
- copy&paste myšou
- ľavým tlačidlom a ťahaním po texte označíme
- kliknutím stredného tlačidla (kolieska) vložíme kam potrebujeme
- ak nemáme stredné tlačidlo, klikneme naraz pravým aj ľavým