Introduction: Rozdiel medzi revíziami
| Riadok 31: | Riadok 31: | ||
Tieto budú doplnené poznatkami z odborných článkov a ďalšej literatúry. | Tieto budú doplnené poznatkami z odborných článkov a ďalšej literatúry. | ||
| + | |||
| + | <div id="fb-root"></div> | ||
| + | <script>(function(d, s, id) { | ||
| + | var js, fjs = d.getElementsByTagName(s)[0]; | ||
| + | if (d.getElementById(id)) return; | ||
| + | js = d.createElement(s); js.id = id; | ||
| + | js.src = "//connect.facebook.net/en_US/sdk.js#xfbml=1&version=v2.5"; | ||
| + | fjs.parentNode.insertBefore(js, fjs); | ||
| + | }(document, 'script', 'facebook-jssdk'));</script> | ||
| + | <div style="width:30%; max-width: 350px; min-width: 250px; padding:30px; float:right;"> | ||
| + | <div class="fb-page" data-href="https://www.facebook.com/Computational-Biology-at-Comenius-University-in-Bratislava-1186005448094730/" data-tabs="timeline" data-height="600" data-small-header="true" data-adapt-container-width="true" data-hide-cover="false" data-show-facepile="false"></div> | ||
| + | </div> | ||
Verzia zo dňa a času 07:47, 22. september 2016
Rozvrh
- Prednáška: štvrtok 15:40-17:10 F1-328
- Cvičenie (pre inf): štvrtok 14:00-15:30 F1-328
- Cvičenie (pre biol): štvrtok 17:20-18:50 M-217
Prednášajúci
- doc. Mgr. Broňa Brejová, PhD. M-163
- Mgr. Tomáš Vinař, PhD. M-163
- Konzultácie po dohode emailom
Ciele predmetu
Tento predmet je určený pre študentov informatických aj biologických odborov. Prednášky budú spoločné pre všetkých, cvičenia budú zvlášť pre informatikov a biológov a poskytnú potrebné doplňujúce informácie.
- Pre všetkých: podať prehľad základných metód používaných na výpočtovú analýzu biologických sekvencií a ďalších dát v molekulárnej biológii.
- Pre informatikov: prehĺbiť/získať znalosti z algoritmov a dátových štruktúr, strojového učenia a pravdepodobnosti. Na príkladoch z biológie ukázať, ako prejsť od problému v reálnom svete k matematickej abstrakcii.
- Pre biológov: pochopiť matematické modely tvoriace základ populárnych bioinformatických nástrojov, naučiť sa tieto nástroje používať a interpretovať ich výsledky.
Stručná osnova
Základné pojmy z molekulárnej biológie, algoritmov a strojového učenia. Sekvenovanie a zostavovanie genómov. Hľadanie génov. Zarovnávanie sekvencií. Evolučné modely a fylogenetické stromy. Komparatívne metódy. Štruktúra RNA. Hľadanie motívov a analýza expresie génov. Štruktúra a funkcia proteínov. Úvod do populačnej genetiky. Vybrané aktuálne témy.
Literatúra
Mnohé základné pojmy budú preberané podľa kníh:
- Durbin, Eddy, Krogh, Mitchison: Biological sequence analysis. Cambridge University Press 1998.
- K dispozícii v knižnici FMFI k prezenčnému používaniu, signatúra I-INF-D-21
- Zvelebil, Baum: Understanding Bioinformatics. Taylor & Francis 2008.
- K dispozícii v knižnici FMFI k prezenčnému používaniu, signatúra I-INF-Z-2
Tieto budú doplnené poznatkami z odborných článkov a ďalšej literatúry.
<script>(function(d, s, id) {
var js, fjs = d.getElementsByTagName(s)[0]; if (d.getElementById(id)) return; js = d.createElement(s); js.id = id; js.src = "//connect.facebook.net/en_US/sdk.js#xfbml=1&version=v2.5"; fjs.parentNode.insertBefore(js, fjs);
}(document, 'script', 'facebook-jssdk'));</script>
