2-AIN-506 a 2-AIN-252: Seminár z bioinformatiky (2) a (4)
Leto 2015
Rozvrh

Seminár:
Utorok 17:20, M-I
Vyučujúci:
Mgr. Tomáš Vinař, PhD	M-163,

doc. Mgr. Broňa Brejová, PhD	M-163,

Oznamy:
Prvé stretnutie sa uskutoční 17.2. o 17:20, kde preberieme organizačné detaily a budeme mať aj prvú prezentáciu.
Zoznam prezentácií:

17.2.2015 Broňa Brejová	Najeeb Halabi, Olivier Rivoire, Stanislas Leibler, Rama Ranganathan. Protein sectors: evolutionary units of three-dimensional structure. Cell, 2009. link prezentácia: pozri neskôr
24.2.2015 Mio Hozza	Qingpeng Zhang, Jason Pell, Rosangela Canino-Koning, Adina Chuang Howe, C. Titus Brown. These are not the k-mers you are looking for: efficient online k-mer countingusing a probabilistic data structure. PLoS One, 2014. link prezentácia: pozri neskôr
3.3.2015 Vlado Boža	Leena Salmela, Eric Rivals. LoRDEC: accurate and efficient long read error correction. Bioinformatics, 2014. link prezentácia: pozri neskôr
10.3.2015 seminár nebude
17.3.2015 Albert Herencsár	Derrick E. Wood, Steven L. Salzberg. Kraken: ultrafast metagenomic sequence classification using exact alignments. Genome biology, 2014. link prezentácia: pozri neskôr
24.3.2015 seminár nebude
31.3.2015 Pavol Lukča	Beth L. Dumont, Evan E. Eichler. Signals of historical interlocus gene conversion in human segmental duplications. PLoS One, 2013. link prezentácia: pozri neskôr
7.4.2015 Veľkonočný utorok, seminár nebude
14.4.2015 konferencia RECOMB, seminár nebude
21.4.2015 Michal Valíček	John Huddleston, Swati Ranade, Maika Malig, Francesca Antonacci, Mark Chaisson, Lawrence Hon, Peter H. Sudmant, Tina A. Graves, Can Alkan, Megan Y. Dennis, Richard K. Wilson, Stephen W. Turner, Jonas Korlach, Evan E. Eichler. Reconstructing complex regions of genomes using long-read sequencing technology. Genome research, 2014. link prezentácia: pozri neskôr
28.4.2015 Dávid Simeunovič	Stephen B. Montgomery, David L. Goode, Erika Kvikstad, Cornelis A. Albers, Zhengdong D. Zhang, Xinmeng Jasmine Mu, Guruprasad Ananda, Bryan Howie, Konrad J. Karczewski, Kevin S. Smith, Vanessa Anaya, Rhea Richardson, Joe Davis, Daniel G. MacArthur, Arend Sidow, Laurent Duret, Mark Gerstein, Kateryna D. Makova, Jonathan Marchini, Gil McVean, Gerton Lunter. The origin, evolution, and functional impact of short insertion-deletion variantsidentified in 179 human genomes. Genome research, 2013. link prezentácia: pozri neskôr
5.5.2015
12.5.2015
19.5.2015