1-BIN-301, 2-AIN-501 Methods in Bioinformatics, 2023/24

Introduction · Rules · Tasks and dates · Materials · Moodle
Quizzes can be found in Moodle.
Homework assignments and journal club papers can be found in Tasks and dates.
Exam rules, example questions and syllabus
Groups for journal club have each their own group in Moodle.


Výsledky vyhľadávania

Prejsť na: navigácia, hľadanie
  • ** po 1.6% označených CG, GC. ...cted DNA sequence(s)" by sa Vam malo v oboch riadkoch objavit "Pasted file 1"
    14 KB (1 797 slov) - 11:57, 16. november 2023
  • ...enne musia mat celociselne hodnoty, alebo dokonca povolime iba hodnoty 0 a 1. * Pouzijeme binarne premenne x_1..x_n, kde x_i = 1 prave vtedy ked sme zobrali i-ty predmet.
    6 KB (991 slov) - 10:03, 14. december 2023
  • ** G = dlzka genomu, napr. 1 000 000 ** Priklad 1: hodime idealizovanou kockou, premenna X bude hodnota, ktoru dostaneme
    85 KB (10 405 slov) - 20:30, 1. október 2014
  • ...tem for course discussion and announcements<!-- , within course team "2021 1-BIN-301 Methods in Bioinformatics". -->
    635 B (98 slov) - 11:03, 21. september 2022
  • ** Hint 1: Kosmáč bielofúzy je po anglicky Marmoset
    3 KB (531 slov) - 23:08, 11. september 2016
  • ** Verzia z 1.10.2015: [[Media:skripta-2015-10-01.pdf|pdf]] | || colspan="3" | '' BV kap. 1''
    153 KB (24 430 slov) - 14:44, 1. december 2016
  • * Priklad 1: hodime idealizovanou kockou, premenna X bude hodnota, ktoru dostaneme * Mozne hodnoty 1,2,..,6, kazda rovnako pravdepodobna
    122 KB (18 985 slov) - 11:18, 4. október 2012
  • * Strom s n vrcholmi ma n-1 hran * Zakoreneny binarny strom s n listami ma n-1 vnutornch vrcholov, teda 2n-2 hran
    125 KB (19 534 slov) - 21:35, 2. október 2011
  • ...biotechnology, 37(2), pp.152-159. https://doi.org/10.1038/s41587-018-0010-1 '''Man, Király, Pidlypska, Bisták, Pizarroso Troncoso, Mayoz Aranda, Alon ...g phosphorylation sites and mutations in cancer. Nature communications, 12(1), p.2313. https://doi.org/10.1038/s41467-021-22481-w '''Lebed, Korbeľová,
    4 KB (520 slov) - 10:17, 19. október 2023
  • ...nania, v ktorom má každá pozícia pravdepodobnosť p, že bude zhoda a (1-p), ze bude nezhoda alebo medzera, zarovnanie ma dlzku L * Nahodna premenna X_i = 1 ak na pozicii i je zhoda, 0 inak
    15 KB (2 339 slov) - 12:10, 20. október 2023
  • ..., v ktorom má každý vnútorný vrchol 2 deti. Takýto strom vždy má n-1 vnútorných vrcholov a 2n-2 vetiev (prečo?) ...aciu takychto vymen dostavame ine poradie, celkovy pocet poradi je 2<sup>n-1</sup>
    9 KB (1 586 slov) - 16:20, 26. október 2023
  • IQ-TREE 1.5.5 built Jun 21 2017 A-T: 1.0000
    18 KB (1 328 slov) - 18:18, 15. november 2018
  • * Napr mame mince hodnoty 1,2,5 centov, z kazdej dostatok kusov * Ake je riesenie? 5+5+2+1 (4 mince)
    151 KB (21 741 slov) - 21:11, 1. október 2014
  • ** Verzia z 2.1.2014: [[Media:skripta-2015-10-01.pdf|pdf]] | || colspan="3" | '' ZB kap. 1''
    169 KB (24 780 slov) - 17:10, 12. november 2015
  • ...a matematicka teoria [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/tutorial/Altschul-1.html] * Napr blastn pre skorovaci system zhoda 1, nezhoda -1, medzera -2 používa lambda=0.800, K=0.0640
    3 KB (525 slov) - 14:08, 19. október 2023
  • ** Nech listy su 1..n a vnut. vrcholy n+1..2n-1, pricom koren je 2n-1. ...modeli <math>P(A|A,t) = (1+3e^{-\frac{4}{3} t})/4 </math>, <math>P(C|A,t)=(1-e^{-\frac{4}{3} t})/4</math>
    3 KB (528 slov) - 10:16, 12. november 2020
  • <math>Pr(S, A) = \pi_{A_1} e_{A_1,S_1} \prod_{i=2}^n a_{A_{i-1, A_i}} e_{A_i, S_i} </math> ** <math>V[1,u] = \pi_u e_{u,S_1}</math> (*)
    8 KB (1 364 slov) - 09:31, 28. október 2020
  • ...se-1-phosphate uridylyltransferase u baktérie Haemophilus influenzae (GAL-1-P) ([https://www.uniprot.org/uniprot/P31764 Uniprot]) ** GAL-1-P má domény [https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/pfam/PF02744/ GalP_UDP_
    7 KB (1 097 slov) - 11:47, 7. december 2023
  • cd 1-seq spades.py -t 1 -m 1 --pe1-1 miseq_R1.fastq.gz --pe1-2 miseq_R2.fastq.gz -o spades > spades.log
    6 KB (1 023 slov) - 15:13, 16. november 2023
  • ** <math>\Pr(S_i|W,o_i) = \prod_{j=1}^{L} W[S_i[j+o_i-1],j] \prod_{j=1}^{o_i-1} q[S_i[j]] \prod_{j=o_i+L}^m q[S_i[j]]</math> ** <math>\Pr(S|W,O) = \prod_{i=1}^n \Pr(S_i|W,o_i)</math>
    13 KB (2 145 slov) - 20:22, 18. november 2020

Zobraziť (predošlých 20 | ďalších 20) (20 | 50 | 100 | 250 | 500).